sexta-feira, 25 de setembro de 2009

Pyscience Brasil

Aproveitando o embalo da postagem sobre Bioinformática, aproveito para divulgar aqui um Wiki na Wikidot sobre python para a ciência. Foi uma idéia de um grupo de pythonistas que estavam presentes na PythonBrasil 3 em Joinville, que implementamos logo em seguida.

Eu costumo contribuir com a parte de códigos e programas em python para bioinformática (embora ultimamente esteja devendo um pouco), principalmente na análise de seqüências de DNA e proteína usando principalmente Biopython, como o uso remoto e/ou massivo de diversas ferramentas do NCBI assim como geração de logos de seqüências. Também contribuo na parte de estrutura tridimensional de proteínas e estatística. Entretanto, o pyscience-brasil contém textos para as mais diversas áreas do python com aplicação científica, como gráficos (Pylab), matrizes, (Numpy) , probabilidade e estatística (RPy e Scipy), e outras diversas "calculeiras" (Scipy).

Fica ai o link e o chamado para contribuição!

Pyscience Brasil



Abs,

Biologia e Computação

Recentemente escrevi um artigo de divulgação científica sobre Biologia e Computação, tentando discutir as inspirações recíprocas de ambas as áreas. Isto é, tentei fazer um cronograma histórico (em linguagem simples, sem o peso da estatística e da programação envolvidas) sobre a bioinformática e os algorítimos de inteligência artificial utilizados pela Biologia, principalmente pela Biologia Molecular e Bioquímica. Pelo outro lado, tentei escrever sobre as mais famosas inspirações "biológicas" da computação, como redes neurais artificiais e algorítimos genéticos.

Deixo aqui então o link para o texto publicado na revista In silico.

Biologia e Computação: trevas e luz